يستهدف نظام جائزة جامعة السلطان قابوس للنشر العلمي وبراءات الاختراع تشجيع المبادرات البحثية للباحثين في مجال تخصصهم وخبراتهم العلمية. وزيادة السعة البحثية، وتنمية القدرات الإبداعية لديهم، وتحقيق التميز العلمي والمعرفي، وتحسين تصنيف الجامعة المحلي والعالمي للإنتاج العلمي، وزيادة اعداد المنشورات العلمية وتحسين جودتها، إلى جانب تعزيز الاهتمام بها لدعم التنمية الاقتصادية والاجتماعية في سلطنة عمان.