مؤسس المدرسة هو الشيخ سعيد بن علي بن جمعة بن سعيد المغيري، ولد سنة 1300هـ/1883م، في عمان بفلج المشايخ التابع لجعلان بني بوحسن، من أم مشايخية، وتربي على يد جده العلامة جمعة بن سعيد المغيري، وفي عام 1323هـ بعث الشيخ سعيد إلى الجزيرة الخضراء في زنجبار حيث يوجد ابن عمه الشيخ محمد بن جمعة بن علي المغيري.