وثيقة
Characterization of genetic diversity of Omani lime (Citrus aurantifolia Swingle)
الناشر
Sultan Qaboos University
ميلادي
2011
اللغة
الأنجليزية
الملخص الإنجليزي
Acid lime (Citrus aurantifolia Swingle) is the fourth largest fruit crop in terms of cultivated area and production in Oman. However, over half a million lime trees were lost in Oman over the past 35 years due to witches' broom disease of lime (WBDL) which is caused by Candidatus Phytoplasma aurantifolia. Surveys from different parts of Oman showed that WBDL is present largely in all districts where 95 out of 122 (78%) surveyed farms were found WBDL positive. AFLP analysis of 143 Phytoplasma-free acid lime samples from Oman, 2 from Brazil and one from Pakistan using 4 primer pair combinations produced 980 polymorphic loci (100%) and 146 AFLP genotypes. Despite the long history of acid lime cultivation in Oman, populations of lime from different districts showed low levels of genetic diversity
(0.0888-0.2284). AMOVA analysis indicated the existence of high level of genetic differentiation (Fst = 0.271) among populations of acid lime from Oman and Brazil, which suggests that both populations have evolved independently for a considerably long period of time. On the other hand, AMOVA analysis showed that only 11% of the genetic variation exists among populations from the 18 different districts in
Oman, which suggests a constant level of gene flow (Nm = 2.04) of acid lime across geographical regions in Oman. Findings from this study suggest that the low level of genetic diversity of acid lime in Oman together with the constant rate of gene flow among districts are two main factors which may have contributed to the rapid spread and high susceptibility of acid limes to WBDL in the country. Unless proper management strategies are undertaken, these factors may make acid lime in Oman more vulnerable to future disease outbreaks.
المجموعة
URL المصدر
الملخص العربي
يعتبر الليمون الحامض في المرتبة الرابعة من حيث المساحة المزروعة والإنتاج في السلطنة. وخلال ال 35 سنة الماضية تم فقد ما يزيد عن نصف مليون شجرة ليمون في عمان وذلك بسبب انتشار مرض مكنسة الساحرة والذي يعد الفايتوبلازما (Candidatus Phytoplasma aurantifolia ) المسبب الرئيسي له.
أوضح المسح الذي شمل عدة ولايات مختلفة في عمان أن هذا المرض يوجد في كل المناطق التي شملها المسح، وفي 45 مزرعة من أصل ۱۲۲ مزرعة تم مسحها أي بنسبة ۷۸%. تم استخدام تحليل البصمة الوراثية (AFLP) على 143 عينة ليمون حامض خالية من الإصابة بالفايتوبلازما تم جمعها من عمان بالإضافة إلى عينتين من البرازيل وأخرى من باكستان وذلك باستخدام أربع بادئات (primers) حيث أنتج التحليل ۹۸۰ موقع جيني مختلف (۱۰۰%) و 146 صنف جيني، وبالرغم من التاريخ الطويل لزراعة الليمون الحامض في عمان فان الدراسة كشفت عن وجود مستوى منخفض جدا( ۰۲۲۸۹-۰٫۰۸۸۸) من التنوع الجيني بين أشجار الليمون الحامض في عمان. كما أوضحت التحاليل أن الاختلاف الجيني بين أشجار الليمون ذات الأصول العمانية واشجار الليمون ذات الأصول البرازيلية يقدر بحوالي (۲۷۱,. = Fsr) وهي نسبة مرتفعة، مما يدل على أن كلا الأصلين تطور بشكل مستقل لمدة طويلة من الزمن. أما بالنسبة لعينات الليمون الحامض التي تم تجميعها من ۱۸ ولاية مختلفة من عمان فقد أوضحت التحاليل أن % ۱۱ من التنوع الجيني يتركز بين أشجار الليمون المنتسبة إلى تلك الولايات المختلفة وأن هناك انتقال للجينات بشكل مستمر وثابت ( ۲ , 04 = Nm) وذلك حسب تحليل AMOVA. النتائج المستخلصة من هذه الدراسة توضح بان المستوى المنخفض التنوع الجيني في الليمون العماني بالإضافة إلى انتقال الجينات بمعدل ثابت و مستمر بين أشجار الليمون بين مختلف الولايات كانا السببين الرئيسيين في الانتشار السريع والواسع لمرض مكنسة الساحرة في الليمون وكذلك انعدام المقاومة في الليمون الحامض لهذا المرض، وعليه فان هذه العوامل قد تجعل من الليمون العماني في عمان أكثر عرضة للإصابة باي مرض في المستقبل ما لم تتخذ الإستراتيجيات الملائمة للوقاية من تلك الأمراض.
أوضح المسح الذي شمل عدة ولايات مختلفة في عمان أن هذا المرض يوجد في كل المناطق التي شملها المسح، وفي 45 مزرعة من أصل ۱۲۲ مزرعة تم مسحها أي بنسبة ۷۸%. تم استخدام تحليل البصمة الوراثية (AFLP) على 143 عينة ليمون حامض خالية من الإصابة بالفايتوبلازما تم جمعها من عمان بالإضافة إلى عينتين من البرازيل وأخرى من باكستان وذلك باستخدام أربع بادئات (primers) حيث أنتج التحليل ۹۸۰ موقع جيني مختلف (۱۰۰%) و 146 صنف جيني، وبالرغم من التاريخ الطويل لزراعة الليمون الحامض في عمان فان الدراسة كشفت عن وجود مستوى منخفض جدا( ۰۲۲۸۹-۰٫۰۸۸۸) من التنوع الجيني بين أشجار الليمون الحامض في عمان. كما أوضحت التحاليل أن الاختلاف الجيني بين أشجار الليمون ذات الأصول العمانية واشجار الليمون ذات الأصول البرازيلية يقدر بحوالي (۲۷۱,. = Fsr) وهي نسبة مرتفعة، مما يدل على أن كلا الأصلين تطور بشكل مستقل لمدة طويلة من الزمن. أما بالنسبة لعينات الليمون الحامض التي تم تجميعها من ۱۸ ولاية مختلفة من عمان فقد أوضحت التحاليل أن % ۱۱ من التنوع الجيني يتركز بين أشجار الليمون المنتسبة إلى تلك الولايات المختلفة وأن هناك انتقال للجينات بشكل مستمر وثابت ( ۲ , 04 = Nm) وذلك حسب تحليل AMOVA. النتائج المستخلصة من هذه الدراسة توضح بان المستوى المنخفض التنوع الجيني في الليمون العماني بالإضافة إلى انتقال الجينات بمعدل ثابت و مستمر بين أشجار الليمون بين مختلف الولايات كانا السببين الرئيسيين في الانتشار السريع والواسع لمرض مكنسة الساحرة في الليمون وكذلك انعدام المقاومة في الليمون الحامض لهذا المرض، وعليه فان هذه العوامل قد تجعل من الليمون العماني في عمان أكثر عرضة للإصابة باي مرض في المستقبل ما لم تتخذ الإستراتيجيات الملائمة للوقاية من تلك الأمراض.
قالب العنصر
الرسائل والأطروحات الجامعية
حجم الملف
2.71 ميغا بايت
2
0
