وثيقة
Determination of ldl cholesterol polygenic score in patients with familial hypercholesterollemia
الناشر
Sultan Qaboos University
ميلادي
2018
اللغة
الأنجليزية
الملخص الإنجليزي
Background: Familial hypercholesterolemia (FH) is characterized by elevated levels of low-density lipoprotein (LDL) in the blood. FH previously thought to have a monogenic basis, but can also be caused by building up of common small-effect LDL-C-raising alleles (polygenic). The Global Lipid Genetic Consortium (GLGC) meta-analysis of genome-wide association studies identified several loci where common variants affect LDL-C concentration. Objective: The aim of this work was to determine polygenic score in FH patients, assess the utility of 6-SNP polygenic score or 12-SNPs polygenic score in identification of polygenic FH, and to study the contribution of polygenic effect on LDL-C before and after lipid lowering therapy.
• Methods: The study subjects were obtained from a previously ongoing study on patients with FH. Total of 93 extracted DNA from patients and control subjects. The data collected from Sultan Qaboos University Hospital (SQUH). The genotypes of the 12 SNPs used to calculate the polygenic score, and then data analysis was done using statistical analysis tests. Results: Positive correlations found between the 12-SNPs and the 6-SNPs polygenic score in individuals (Pearson's R-Coefficient =0.89, P-value <0.0001). LDL-C SNP 12 score of FH/M+ group, (0.98 (SD 0.13]) was statistically not significant to the healthy control group (0.97 (SD 0.23]), P-value =0.858. Also, the FH/M- group (1.02 [SD 0.11]) compared to the control group (0.97 [SD 0.23]), P-value =0.2204. As the FH/M- group and FH/M+ group showed no significant difference in both groups was, P-value = 0.2. In conclusion, the utility of 6-SNPs polygenic score in measurement of polygenic markers for FH, adds cost and effort-effective approach compared to 12 SNPs polygenic score. Also the reported GLGC weights of LDL-C failed to differentiate between polygenic familial hypercholesterolemia and monogenic forms in the Omani population. Future studies are required to establish LDL-C polygenic score on Arabic population. Keywords: Familial Hypercholestrolemia, polygenic, SNP
الوصف
Thesis
المجموعة
URL المصدر
الملخص العربي
المقدمة: فرط كوليستيرول الدم العائلي (FH) هو اضطراب وراثي يتميز بمستويات مرتفعة من البروتين الدهني منخفض الكثافة (LDL) في الدم ، مما يؤدي إلى مرض القلب والأوعية الدموية في وقت مبكر من العمر. أهمية التشخيص المبكر ل FH تؤثر على تشخيص المريض والعلاج ، وأساليب المكافحة عادة ما تكون وراء السيطرة على النظام الغذائي واستخدام الستاتين: فرط كوليسترول الدم العائلي (FH) له أساس أحادي المنشأ (monogenic) ، ولكن يمكن أيضا أن يكون سببه تراكم الأليلات الوراثية الشائعة (polygenic) ذات التأثير الضئيل على مستوى ( LDL - C ) في الدم. ما يقارب 60 ٪ من المرضى الذين يعانون من فرط كوليسترول الدم العائلي يتم تشخيصهم مع عدم وجود طفرة في الجينات الأربعة الممكنة ل FH ، واتحاد التحليل الوراثي العالمي Global Lipid Genetic GLGC Consortium ) )حدد العديد من المواقع لبSNPs التي تؤثر على تركيز مستويات الكولستيرول في LDL - C . كان الهدف من هذا العمل هو تحديد متعدد الجينات (polygenic score) عن طريق الكشف عن مرضى FH الذين يعانون من طفرات إيجابية وسلبية ، وتقييم فائدة استخدام الى 6-SNPs أو 12-SNPs متعدد الجينات (polygenic score) في تحديد مرضى FH، ودراسة مساهمة التأثير متعدد الجينات polygenic) (score على مستوى LDL - C في الدم و الاستجابة للعلاج بخفض الدهون. الطريقة: تم الحصول على 93 عينة من دراسة سابقة على مرضى FH و تم الحصول على الحمض النووي المستخرج (DNA)من المرضى و أفراد العائلة. تم دراسة النمط الوراثي عينات من الحمض النووي باستخدام فحوصات مختلفة لتمييز الموروث عن طريق الى 12- SNP. النتائج تم العثور على علاقة موجبة بين12-SNPs و 6-SNPs النتيجة الجينية في الأفرا (- Pearson ' s R 0 . 0001> Coefficient = 0 . 89 , P - value ). لم تكن درجة 12-SNP لمجموعة( +SD 0 . 98 , FH / M ] ) [ 0 . 13ذات دلالة إحصائية لمجموعة التحكم الصحية ( 0 . 97 ,[ 0 . 23 P - value = 0 . 858 [ SD ). أيضأ ، مجموعة (-SD 0 . 11 ] , 1 . 02 FH / M ]) مقارنة بمجموعة التحكم ( 0 . 97 [ 0 . 23 P - value = 0 . 22 [ SD ). كما أظهرت المجموعة - FH / M و FH / M لا يوجد فرق كبير في كلا المجموعتين ، 0 . 2 = P - value الخلاصة: فائدة 6-SNP لحساب الدرجة الجينية في قياس علامات متعددة الجينات (polygenic score) إلى FH من حيث التكلفة والجهد مقارنة مع 12-SNP. كما أخفقت GLGC weights من LDL - C في التفريق بين فرط كوليسترول الدم العائلي متعدد الجينات والأشكال أحادية المنشأ في السكان العمانيين. كما أن هناك حاجة لدراسات مستقبلية لتحديد درجة جينات LDL - C على السكان العرب.
قالب العنصر
الرسائل والأطروحات الجامعية
حجم الملف
2.2 ميغا بايت
0
0
