إن اتخاذ الديانات موضوعا للبحث ثم للنقد من قبل العلماء المسلمين له ما يبرره. من أولى هذه المسوغات أن الإمبراطورية العربية الإسلامية المترامية الأطراف كانت تتألف من أغلبية مسلمة وأقليات يهودية ومسيحية يختلف عدد الواحدة منها باختلاف المناطق والأمصار. وقد استطاعت هذه الأقليات المنتشرة هنا وهناك أن تحقق في إطار عقد الذمة الذي سنه الإسلام لأهل الكتاب. امتیازات عديدة من قبيل حرية التنقل والإقامة وحرمة المسكن وحرية أداء الطقوس الدينية وحق التمتع بالمرافق العامة للدولة وكفالة بيت المال. ناهيك عن تمتع هذه الأقليات بحقوق سياسية واجتماعية مختلفة. لاشك في أن هذه الامتيازات كانت هي الأفضل إذا ما قارناها بالقيود الكثيرة التي كانت تفرض مثلا على اليهود في العالم المسيحي آنذاك.