وثيقة
Isolation, molecular characterization and sero-epidemiology of foot-and-mouth disease virus in the Sultanate of Oman.
المصدر
Doctoral dissertation
عناوين أخرى
العــــزل والتـــوصيف الجزيئــي والوبائيات المصلية لفيــروس الحمــى القــــلاعية في سلطنة عمـــــــان
الدولة
Oman
مكان النشر
Muscat
الناشر
Sultan Qaboos University
ميلادي
2024
اللغة
الأنجليزية
الموضوع
نوع الرسالة الجامعية
Doctoral dissertation
الملخص الإنجليزي
Foot-and-mouth disease (FMD), a highly contagious viral illness affecting cloven-hoofed
animals, is prevalent in the Sultanate of Oman, with yearly outbreaks, especially in winter
and spring. This study presents the first comprehensive genetic characterization of FMD
virus (FMDV) in Oman, including the first isolation of FMDV SAT 2/VII and
A/AFRICA/G-I strains in the country.
A total of 170 (85.43%) oral epithelial tissue samples tested positive for the FMDV
genome by RT-PCR, with an infectivity rate of 68.82%. Serotype-specific competitive
Ag-ELISA identified three FMDV serotypes: O, A, and SAT 2. VP1 sequencing revealed
two topotypes of serotype O (EA-3 and ME-SA) and three lineages within ME-SA, SA2018, PanAsia-2/ANT-10, and Ind-2001e.
Phylogenetic analysis placed serotype A sequences within the AFRICA topotype and the
G-I genotype, related to strains from Bahrain and Kenya. SAT 2 viruses were grouped
within topotype XIV, similar to the Ethiopian strains. Reports of vaccine matching of
genetically related viruses to Oman strains showed good antigenic matching with most of
the tested vaccine strains, except for FMDV serotype A strains.
Additionally, serum samples were collected from 315 animals across all governorates of
Oman to assess the seroprevalence of FMD in potentially infected animals. The analysis
indicated an overall seroprevalence of 43.5 %, with higher rates in older cattle.
These findings highlight the need for effective quarantine measures to mitigate
transboundary FMD transmission from East Africa and Western Asia. Further research is
necessary to evaluate post-vaccination immunity against field isolates, aiding the
development of targeted control strategies.
الملخص العربي
مرض الحمى القلاعية هو مرض فيروسي معدي، يصيب الحيوانات مشقوقة الظلف المستأنسة والبرية، ينتشر بشك ٍل واسع في سلطنة عمان مع ظهور مستمر لجوائح المرض خاصة خلال فصلي الشتاء والربيع. يعدّ هذا البحث هو الاول من نوعه في سلطنة ُعمان والذي يُف ِّّصل التوصيف الجيني لفيروسات مرض الحمى القلاعية المعزولة من مختلف محافظات السلطنة، جنبًا إلى جنب مع الفيروسات ذات الصلة الوثيقة التي تم اكتشافها مؤخ ًرا في أماكن أخرى والتي يستوطن فيها مرض الحمى القلاعية. كما كشف هذا البحث وألول مرة عن النمط المصلي والجيني )VII2/ SAT )و )I-G/AFRICA/A )لفيروس الحمى القلاعية في سلطنة ُعمان. ولتحقيق أهداف هذه الدراسة، تم جمع )199( عينة من الاغشية المخاطية المبطنة للتجويف الفموي، وقد كشفت نتائج الاختبارات عن وجود نسبة )%85.43( للحمض الريبي النووي )RNA )في باستخدام اختبار تفاعل البلمرة التسلسلي اللحظي )PCR-rtRT). من أجل عزل الفيروس، تم زرع العينات الايجابية للعينات الاغشية المخاطية المبطنة للتجويف الفموي واللعاب نوعين من المزارع الخلوية النسيجية الحساسة لفيروس الحمى القلاعية، حيث بيّنت النتائج أن معدل الاصابة ا اختبار في المزارع الخلوية النسيجية الاغشية المخاطية المبطنة للتجويف الفموي كان بنسبة .%68.82 ثم أجري الحقً المقايسة المناعية الامتصاصية المرتبطة بالانزيم )ELISA )على العزوالت الفيروسية وذلك للكشف عن الانماط ُ المصلية )Serotypes )ثبت وجود ثالثة أنماط مصلية لفيروس الحمى القلاعية في سلطنة المسببة للمرض حيث أ ُعمان وهي Oو Aو 2 SAT أظهر تحليل تسلسل النوكليوتيدات لبروتين 1VP لتوصيف سالالت فيروس الحمى القلاعية للنمط المصلي )O )وجود نمطين جغرافيين )Topotypes )منها 82 عينة تابعة لـ South-East Middle .East Africa-3 (EA-3) الجغرافي للنمط تابعة عينة 22و Asia (ME-SA) في حين تندرج العزوالت الفيروسية ضمن النمط المصلي A تحت النمط الجغرافي والجيني -G/AFRICA I والتي تشترك في التركيبة الجينية مع الفيروسات المعزولة من البحرين وكينيا. ومن جهة أخرى، النمط المصلي 2 SAT يندرج ضمن التركيب الجيني VII والذي تتشابه تركيبته الجينية مع عزوالت من أثيوبيا. وأشارت تقارير مطابقة اللقاحات إلى توافق مستضدي جيد مع معظم سالالت اللقاحات التي تم اختبارها، باستثناء سالالت النمط المصلي A من فيروس FMDV. ولتحديد مدى وبائية مرض الحمى القلاعية في الحيوانات المشتبه إصابتها بالمرض، تم جمع عينات المصل من المجترات )315 عينة( من جميع محافظات السلطنة. حيث تم الكشف عن الاجسام المضادة للبروتينات غير الهيكلية )NSP)، وقد أثبتت النتائج بأن نسبة )%43.5( من العينات كانت مصابة بالمرض. وكشفت النتائج عن وجود ارتباط وثيق للعمر ونوع الحيوان مع نتائج الاختبارات المصلية الايجابية فقد لوحظت أعلى نسبة إصابة في الابقار وبعمر فوق 3 سنوات. استمرار عمليات البحث والتقصي عن مسببات المرض له أهمية قصوى في مكافحة المرض والتقليل من انتشاره من خلال اختيار التحصين الذي يوفر حماية ضد الانماط المنتشرة حقلياً في جميع مناطق سلطنة ُعمان.
قالب العنصر
الرسائل والأطروحات الجامعية