وثيقة
Mutation analysis of KI13B as a candidate gene for autosomal recessive hereditary spastic paraplegia.
الناشر
Sultan Qaboos University
ميلادي
2006
اللغة
الأنجليزية
الموضوع
الملخص الإنجليزي
Hereditary Spastic Paraplegia (HSP) is a descriptive diagnosis of a phenotypically and genetically diverse group of disorders. Researchers have reported autosomal dominant, autosomal recessive, and X-linked recessive mode of inheritance. So far 29 loci have been mapped and 11 genes identified in different chromos clinically classified as two forms, the pure (uncomplicated) and the complicated form which involves other neurodegenerative symptoms. In a recent study, two consanguineous Omani families (A and B) were characterized clinically and radiologically with complicated autosomal recessive HSP. The affected individuals in family A had in addition to spastic paraplegia thin corpus callosum and mental retardation, whereas in family B two of three affected individuals had epilepsy. A genome wide scan and linkage analysis in both families identified a locus on chromosome 8p12-p11.21. This locus spans 9 CM, between markers D8S1820 and D85532 with the highest combined lod score of 7,077 at marker D8S505, Among the 30 genes located in this region Neuregulin-1 and KF13B are interesting functional candidate genes for HSP. KIF13B gene shares a kinesin motor domain with KIF5A gene located on chromosome 12. Two studies have reported mutations in the kinesis motor domain of KIF5A in two families with autosomal dominant HSP (SPG10). In this study 4 samples from each family (father, mother, affected and unaffected) were screened by sequencing for disease causing mutation in 38 known exons of KIF13B gene. Three SNPs segregating with disease locus in family B were detected, further confirming the genetic locus. In addition, a new SNP in the intronic region at position (115179: A/G) of the gene was detected in family B. This family was found to have more SNPs than family A suggesting a distant genetic relationship. Using RFLP all SNPs were found in 20 random Omani samples. Although no disease causing mutation was found in KIF13B, this gene cannot be excluded as a candidate gene for HSP in these families. Two more exons were added to this gene since this project was started and therefore annotation of this gene may not yet be completed. In addition to the exonic regions, promoter and other regulatory elements need to be sequenced before a final conclusion can be made in the involvement of KIF13B in HSP
المجموعة
URL المصدر
الملخص العربي
الشلل النصفي التشنجي الوراثي يطلق على حالة مرضية تشخص نمطيا ووراثيا لمجموعة من الاعتلالات ذات الضمور العصبي. وقد وجد أن هذا المرض ينتقل وراثيا بالصبغات الوراثية الجسدية المائدة أو المتنحية و الصبغات الجنسية حتى الان تم التعرف على 29 موقعا وراثيا (Genetic loci) بالخريطة الوراثية و 11 موروث في مختلف الصبيغات لهم علاقة بالشلل النصفي التشنجي الوراثي. وينقسم هذا المرض الى نوعين هما : البسيط غير مصاحب باي مرض إضافي والمعهد المعروف لمصاحبته بأمراض أخرى. تم مؤخرا تصنيف بالطرق السريرية والإشعاعية عائلتيين عمانيتين مصابتان بالنوع المعقد ذات الصفة المتحية الجسدية. فالمصابون في العائلة A لديهم إضافة إلى الشلل النصفي التشنجي ضمور شديد بالجسر العصبي الرفيع الرابط بين شطري المخ ( Corpus callossum) و تخلف عقلي . بينما 2 من 3 من العائلة B لديهم الصرع. فباستخدام المعابر الوراثية تم مسح وتحليل العلاقة الوراثية بين المسابر والحالة المرضية في كل من العائلتين B و A وتم تحديد ومعرفة الموقع الوراثي 8p12 - p112 المحصور بمسافة 9cM بين المؤشر D8S1820و D8S532. لقد حدد التحليل الوراثي المرتبط (Genetic Linkage analysis) مستوى تجمع اعلى (Lod score) بمقياس 7 . 077 عند المؤشر D8S505. يعتبر مورث 1-Neuregulin و KIF13B اهم المورثات في هذا الموقع ولربما لهما دور في الشلل النصفي التشنجي الوراثي. فالموروث KTF13B به الحقل الحركي (Motor domain مشابه للمورث KIFSA الواقع في الصبيغة 12 والذي وجد ان به طفرة وراثية في إحدى العائلات المصابة بالشلل النصفي التشنجي الوراثي من النوع الجسدي السائد (SPG10 ). ففي هذا البحث تم دراسة 4 عينات من كل عائلة ( أب وأم و مصاب وسلیم) لتحليل الموروث KIF13B باستخدام التسلسل الوراثي ( Sequencing) للتعرف فيما إذا كان هنالك طفرات بهذا الموروث مرتبطة بالشلل النصفي التشنجي الوراثي في 38 إكسون. لم تظهر نتيجة تحليل التسلسل الوراثي وجود أي طفرات وراثية لها علاقة بالمرض. لكننا وجدنا ثلاث تغيرات أحادية النيوكليوتاید SNP ) Single Nucleotide) Polymorphism تتوارث مع المرض في العائلة B وجدنا كذلك متغيرة جديدة (SNP بالموقع :115179 A / G بالعائلة B والتي لاحظنا أن لديها عدد اكثر من (SNP) مقارنة بالعائلة A . وعن طريق إستخدام RFLP في 20 عينية عشوائية عمانية وجدنا أن هذه التغيرات موجودة بالعمانيين. وبالرغم من أننا لم نجد طفرة وراثية بالموروث KTF13B تسبب هذا المرض في العائلتين فإننا لا يمكن أن نستثني علاقته بهذا المرض حيث اننا لم نتمكن تحليل مناطق أخرى في الموروث KIF13B كالاكسون (38 ,3 ,1) و العناصر المسيطرة.
قالب العنصر
الرسائل والأطروحات الجامعية