وثيقة

A Novel missense mutation in the C2C domain of otoferlin causes profound hearing impairment in an Omani family with auditory neuropathy.

المعرف
DOI: 10.15537/smj.2016.10.14967
المساهمون
الناشر
Saudi Arabian Armed Forces Hospital.
ميلادي
2016-10
اللغة
الأنجليزية
الملخص الإنجليزي
Objectives: To identify genetic defects in an Omani family diagnosed with deafness. Original Articles Methods: A cross-sectional association study was conducted at the Department of Biochemistry, College of Medicine and Health Sciences, Sultan Qaboos University, Al-Khoud, Oman and the Centre of Medical Genetics, University of Antwerp, Antwerp, Belgium between August 2010 and September 2014. Microsatellites markers for nine non-syndromic genes were used to genotype the defective locus using the extracted DNA from family members. Sanger sequencing method was used to identify the disease causative mutation. Eazy linkage 5.05 was used to calculate the logarithm of odds score. Lasergene suite was used to detect the mutation position, and Phyre2, SMART, Rasmol, and GOR IV were used to predict the effects of the defect on protein structure and function. Results: The disease was linked to markers located on chromosome-2 and covering the OTOF (DFNB9) gene. A novel missense mutation that changed nucleotide C to G at position c.1469 and consequently the amino acid Proline to Arginine (P490R) on exon 15 was detected. Protein modeling analysis revealed the impact of the mutation on protein structure and the relevant C2C domain. The mutation seems to create a new protein isoform homologous to the complement component C1q. Conclusion: These findings suggest that the mutation found in C2C domain of the OTOF gene is likely to cause deafness in the studied family reflecting the importance of C2 domains of otoferlin in hearing loss.
ISSN
0379-5284
الملخص العربي
الأهداف: حتديد إمكانية تواجد خلل جيني في أسرة عمانية متكونة من الأقارب والتي مت تشخيصها بالصمم غير المتلازم.
الطريقة: أجريت دراسة مقطعية عرضية ترابطية في قسم الكيمياء الحيوية، كلية الطب والعلوم الصحية، جامعة السلطان قابوس، الخلود، عمان وفي مركز علم الوراثة الطبية بجامعة انتورب، بلجيكا خلال الفترة من أغسطس 2010م إلى سبتمبر 2014م والتي استخدم فيها علامات التحديد الجيني )microsatellite ( markersلتسع جينات الصمم غير المتلازم)2GJB، A7MYO، ،OTOF ،TMPRSS3 ،TMC1 ،SLC26A4 ،MYO15 23CDH، TECTA ) لتحديد موضع أي خلل جيني محتمل في الحمض النووي المستخلص من أفراد الأسرة. وقد استخدمت طريقة ساجنر للتسلسل لتحديد الطفرات المسببة للمرض.
قالب العنصر
مقالات الدوريات

مواد أخرى لنفس الموضوع

مقالات الدوريات
3
0
Simsek, Mehmet.
Wiley-Liss, Inc.
2001-12-01