Document
Acute myeloid leukaemia biomarker discovery using proteomics approaches.
Source
Doctoral dissertation
Other titles
اكتشاف المؤشرات الحيوية لسرطان الدم النخاعي الحاد باستخدام التقنيات البروتينية
Country
Oman
City
Muscat
Publisher
Sultan Qaboos University
Gregorian
2023
Language
English
Subject
Thesis Type
Doctoral dissertation
English abstract
Acute Myeloid leukemia (AML) is a multifaceted hematologic malignancy characterized by a
diverse range of prognoses. Using 16-plex TMT-LC/LC-MS/MS, we focused on a group of
proteins that showed upregulated expression in patients with peripheral blood diseases compared
to healthy controls. These proteins included HMGA1, HNRNPU, HMGN2, H1-2, RCC1, H3-2,
and H1-5. These proteins are implicated in essential biological processes such as Spliceosome
assembly, Nucleotide excision repair mechanism, and Ribosome biogenesis. In addition, it was
shown that ZNF207, SYNCRIP, HMGA1, HNRNPU, HMGN3, RPL26, COA6, COA5, and IER2
exhibited notable variations in expression levels when comparing peripheral blood disorders and
peripheral blood illnesses. This finding implies that these genes may have a potential use in the
diagnosis of AML. The proteins identified in this study were shown to be associated with the
KEGG pathways of Hematopoietic cell lineage, Spliceosome and ATP-dependent chromatin
remodeling.
Also, using ELISA, we examined the influence exerted by the initial levels of JAK/STAT, AKT,
TIM3, IDH1, and IDH2 expressions on the overall survival outcomes of patients diagnosed with
AML. The results of our study indicate that the protein expression levels examined do not have a
significant impact on the outcomes of patients with AML. However, it is important to note that
these findings may differ from past studies, highlighting the need for more investigation in this
area.
The overexpression of these proteins may be responsible for the possible improvement of
prognostic outcomes in patients with AML. To demonstrate a correlation between crucial
indicators and the prognosis of AML, next investigations must prioritize the inclusion of research
trials including significant participant cohorts. This approach will provide a more comprehensive
comprehension of the complicated nature of this illness and its prognostic implications.
Arabic abstract
ابيضاض الدم النخاعي الحاد )AML )هو ورم خبيث دموي متعدد الاوجه يتميز بمجموعة متنوعة من التوقعات. باستخدام -16MS / MS-LC / LC-TMT plex، ركزنا على مجموعة من البروتينات التي أظهرت تعبيرا منظما في المرضى الذين يعانون من أمراض الدم المحيطية مقارنة بالضوابط الصحية. وشملت هذه البروتينات 1HMGA وHNRNPU و2HMGN و 1-2H و 1RCC و 3-2H و 1-5H. هذه البروتينات لها دور في العمليات البيولوجية الاساسية مثل تجميع Spliceosome، وآلية إصالح استئصال النوكليوتيدات، والتكون الحيوي للريبوسوم. بالاضافة إلى ذلك، تبين أن 207ZNF وSYNCRIP و1HMGA وHNRNPU و3HMGN و26RPL و6COA و5COA و 2IER أظهرت اختالفات ملحوظة في مستويات التعبير عند مقارنة اضطرابات الدم المحيطية وأمراض الدم المحيطية. تشير هذه النتيجة إلى أن هذه الجينات قد يكون لها استخدام محتمل في تشخيص ابيضاض الدم النقوي الحاد )AML). تبين أن البروتينات المحددة في هذه الدراسة مرتبطة بمسارات KEGG لساللة الخاليا المكونة للدم، و Spliceosome وATP. وأيضا باستخدام ELISA، قمنا بفحص التأثير الذي تمارسه المستويات الاولية لتعبيرات STAT / JAK وAKT و3TIM و1IDH و 2IDH على نتائج البقاء الاجمالية للمرضى الذين تم تشخيص إصابتهم بابيضاض الدم النقوي الحاد )AML). تشير نتائج دراستنا إلى أن مستويات التعبير البروتيني التي تم فحصها ليس لها تأثير كبير على نتائج المرضى الذين يعانون من ابيضاض الدم النقوي الحاد )AML). ومع ذلك، من المهم مالحظة أن هذه النتائج قد تختلف عن الدراسات السابقة، مما يسلط الضوء على الحاجة إلى مزيد من التحقيق في هذا المجال. قد يكون الافراط في التعبير عن هذه البروتينات مسؤوال عن التحسين المحتمل للنتائج النذير لدى مرضى ابيضاض الدم النقوي الحاد )AML). لإثبات وجود علاقة بين المؤشرات الحاسمة وتشخيص AML، يجب أن تعطي التحقيقات التالية الاولوية لإدراج التجارب البحثية بما في ذلك مجموعات المشاركين المهمين. سيوفر هذا النهج فهما أكثر شموال للطبيعة المعقدة لهذا المرض وآثاره النذير.
Category
Theses and Dissertations