.Detection of mixed infection of tomato yellow leaf curl virus and mungbean yellow mosaic India virus in tomato crop in Oman

.Detection of mixed infection of tomato yellow leaf curl virus and mungbean yellow mosaic India virus in tomato crop in Oman

Author

AL-Sadrani, Mohammed Ahmed Nasser

Publisher

Sultan Qaboos University

Gregorian

2018

Language

English

Subject

Tomatoes

Crop protection

English abstract

Begomoviruses, consisting of single strand DNA viruses (ssDNA), belong to the family Geminiviridae and cause main problems to the world agriculture. Tomato yellow leaf curl disease (TYLCD) is one of the tomato diseases causing destruction to the tomato production in Oman and is caused by diverse begomovirus strains. In the present study, seventy seven tomato plants showing yellowing, curling, crumpling and stunting from Al-Batinah, A'Dakhiliyah, Khasab and Dhofar governorates of Oman were collected. Virus isolates consisting of coat protein of TYLCV, coat protein and nuclear shuttle protein of Mungbean yellow mosaic India virus (MYMIV) and tomato leaf curl betasatellite (ToLCB) were amplified, cloned and sequenced. The sequence analysis showed that 81% of collected samples were infected with monopartite begomovirus TYLCV followed by 29% plants infected with a bipartite begomovirus MYMIV and 42% of the plants were associated with tomato leaf curl betasatellite (ToLCB). However, 29% of tomato plants contained TYLCV, MYMIV and ToLCB as a mixed infection. Although, both begomoviruses and the betasatellite have been reported from different hosts in Oman, this is the first study to show mixed infection by the monopartite and bipartite begomoviruses and betasatellite on tomato crop in the Sultanate. Mixed infection may result in serious effects on tomato production in Oman.

Member of

Theses and Dissertations

Resource URL

https://hdl.handle.net/20.500.12408/3468

Arabic abstract

فيروسات (Begonoviruses) هي فيروسات أحادية الحمض النووي تندرج ضمن عائلة ال Geminiviridae وتمثل واحدة من أكبر المشاكل الرئيسية للزراعة في العالم. يعتبر مرض إصفرار و تجد أوراق الطماطم (TYLCD) أحد أهم الأمراض التي شیب خسائر فادحة في إنتاج الطماطم في سلطنة عمان وهو ناتج عن سلالات متنوعة من فيروسات البيجومو فيروس. في هذه الدراسة، تم جمع سبعة و سبعين عينة من نباتات الطماطم التي يظهر عليها أعراض إصفرار و تكتل الأوراق والتقزم من عدة مناطق في سلطنة عمان تشمل كل من الباطنة ، الداخلة ، خصب ، ظفار والظاهرة وتم البدء في تشخيص العدوى المختلطة تم تضخيم وأستنساخ وتحليل التسلسل الجيني لعزلات الفيروسات المكونة من الغلاف البروتيني (CP) لفيروس إصفراروتجعد أوراق الطماطم (TYLCY) والغات البروتيني (CP و Nuclear shuttle NSP ) Protein ) لفيروس اصفرار وثبرفش اللوبيا الشعاعية (MYMTV) والجزيء بينا المصاحب لإصفرار و تجد أوراق الطماطم (ToLcB). وأظهر تحليل التسلسل الجيتي أن 81% من العينات التي تم جمعها كانت مصابة بفيروس إصفرار وتجعد أوراق المطماطم (TYLC۷) وهو أحادي التركيب (monopartite begonoviruses ) ، تبعها و2% من النباتات مصاب بفيروس إصفرار وتبرقش اللوبيا الشعاعية (MYMI) وهو عبارة عن إزدواجي التركيب ( bipartite begornovinuises). و 42% من النباتات كانت مرتبطة مع وجود الجزيء بينا المصاحب لإصفرار وتجد أوراق الطماطم (ToLcB). و وجد أيضا أن و2ة من نباتات الطماطم تحتوي على TYLCV و MYMI و ToLCB کدوی مختلطة وكما أنه تم تسجيل فيروس إصفرار وتيرقش اللوبيا الشعاعية (MYMIV) والجزيء بيتا المصاحب لإصفراروتجعد أوراق الطماطم (Touc8) علی تباتات مضيفات أخرى في سلطنة عمان ،أظهرت هذه الدراسة ولأول مرة وجود علوی مختلطة لفيروسات أحانية التركيب (monopartite) وثانية التركيب ( bipartite) والجزء بينا المصاحب لإصفرار وتجد أوراق الطماطم (ToucB) علی محصول الطماط في سلطنة عمان والتي قد تزيد من شدة الأصلية وتأثيرها على إنتاج محصول الطماطم بالسلطنة.