Document
Differential expression of SOCS2 gene and Its putative role in ovarian cancer pathogenesis
Publisher
Sultan Qaboos University
Gregorian
2018
Language
English
Subject
English abstract
Epithelial Ovarian Cancer (EOC) is the most lethal disease among gynecologic cancers. It is usually diagnosed at late stages with a poor outcome due to its asymptomatic nature. Statistical estimations revealed around 14,080 deaths out of 22,440, diagnosis in the United States only in 2017, in which less than 40% of women are cured. In Oman, incidence rate of ovarian cancer in 2013 is estimated at 2.2, and 2.9 after age- standardization, per 100,000. Despite the tremendous research effort achieved in this field, genetic mechanisms associated with this disease are still not fully understood. Recently, several biological techniques including microarray, chromatin immunoprecipitation (ChIP) and others, emerged to reveal a bunch of genes with a potential of biomarkers in cancerous cells as compared to normal cells. However, there is no concrete evidence that those biomarkers have a role in the progression and/or early detection of the disease. Therefore, biomarkers for an early-detection of patients at higher risk to develop EOC are urgently needed. In a previous work, we used chromatin immunoprecipitation (ChIP) technique to study the E2F5 transcription factor in ovarian cancer cell line (MCAS and OVSAHO). A mini library was obtained by the enriched chromatin and ChIP-seq was performed to identify the sequences of downstream regulatory elements bounded by E2F5. Among the short-listed genes, SOCS-2 was found to be regulated by the E2F5 gene. Suppressor of Cytokine Signaling 2 (SOCS2) is one of the SOCS family with a role in JAK/STAT transcription pathway. Any disruption in this pathway may lead to many diseases such as immunity disorders and some sort of cancers. Some of these SOCS genes have been suggested to act as biomarker for some cancers. SOCS2 was recently shown to act as an early biomarker for prostate and colorectal cancer. The aim of this study is to explore the role of SOCS2 gene in Epithelial Ovarian Cancer by monitoring the expression of the gene in stages variety of EOC tissues and cell lines. We examined the expression of SOCS2 in tissues and cell lines using the quantitative reverse transcription-polymerase chain reaction (qRT-PCR) to monitor the differential expression of SOCS2 in cancerous and normal tissues. Significant down-regulation of SOCS2 was found in Borderline tissues but it was not significant in other cancer stages such as benign and malignant tissues. Although all examined cell lines (MCAS, OVSAHO and 2008OV) showed a significant downregulation of the gene. SOCS2 methylation status was investigated in tissues and cell lines using MSP. It was revealed that SOCS2 is methylated in OVSAHO cell line but no methylation was detected in MCAS. Cancerous tissues showed partially methylated SOCS2 as well as normal tissues. In conclusion, this study manifested that SOCS2 gene is downregulated at an early stage of EOC. Also, the low expression of the gene could be due to another mechanism rather than hypermethylation of the gene.
Member of
Resource URL
Arabic abstract
سرطان خلايا المبيض الطلائية (EOC من أكثر الأمراض الفتاكة بين السرطانات النسائية وعادة ما يتم تشخيصه في مراحل متأخرة مع نتائج سينة لعدم وجود أعراض له. كشفت تقديرات إحصائية أن هناك حوالي14 ، 080 حالة وفاة من أصل 24 . 440 حالة تشخيص في الولايات المتحدة فقط في عام 2017 ، حيث يتم علاج أقل من 40% من النساء. في عمان ، يقدر معدل الإصابة بسرطان المبيض في عام 2013 بنحو 2. 2 ، و 2.
9 بعد توحيد العمر، لكل 100 . 000 وعلى الرغم من الجهود البحثية الهائلة التي تحققت في هذا المجال ، لا تزال الآليات الوراثية المرتبطة بهذا المرض غير مفهومة تماما. في الآونة الأخيرة ، ظهرت العديد من التقنيات البيولوجية بما في ذلك الmicroarray ، و (ChIP analysis) وغيرها لتكشف عن مجموعة من الجينات مع إمكانية أن تكون هذه الجينات كعلامات بيولوجية (biomarker) في الخلايا السرطانية مقارنة مع الخلايا الطبيعية. ومع ذلك، لا يوجد دليل ملموس على أن تلك العلامات الحيوية (biomarker) لها دور في الكشف المبكر عن المرض. لذلك، هناك حاجة ماسة للواصمات الحيوية (biomarker) للكشف المبكر عن المرضى المعرضين لخطر سرطان المبيض. في عمل سابق باستخدام تقنية ترسيب الكروماتين ( chromatin( ChIP الدراسة عامل النسخ E2F5 في خط خلية سرطان المبيض MICAS) و .(OVSAH0 تم الحصول على مكتبة صغيرة بواسطة الكروماتين المخصب وتم تنفيذ ChIP - Seq لتعريق تسلسل العناصر التنظيمية النهائية التي تحدها (E2F5 TF) و من بين الجينات المدرجة في القائمة القصيرة -S0CS وجد أنها تخضع لتنظيم جين F2F5 كابح اشارة السيتوكين 2 (SOCS2) هو من عائلة SOCS له دور في مسار التسيخ / JAK (STAT) و أي اضطراب في هذا المسار قد يؤدي إلى العديد من الأمراض مثل اضطرابات المناعة وبعض أنواع السرطان. وقد وجد أن بعض هذه الجينات (SOCS) بمثابة العلامة الحيوية (bionarker) لبعض أنواع السرطان. وقد تبين مؤخرا أن SOCS2 بمثابة العلامة الحيوية (biomarker) في وقت مبكر لسرطان البروستاتا وسرطان القولون والمستقيم الهدف من هذه الدراسة هو استكشاف فور جین S0CS2 في سرطان المبيض الظهاري من خلال مراقبة تعبير الجين في مراحل متنوعة الأنسجة EOC وخطوط الخلايا. درسنا التعبير عن SOCS2 في الأنسجة وخطوط الخلايا باستخدام ( qRT - PCR ) لرصد التعبير التفاضلي SOCS2 في الأنسجة السرطانية والعادية تم العثور على تنظيم منخفض بشكل ملحوظ من 50CS2 في أنسجة Borderline لكنه لم يكن كبيرا في مراحل السرطان الأخرى مثل الأنسجة الحميدة والخبيئة. على الرغم من أن جميع خطوط الخلايا التي تم فحصها MICAS و OVSAH0 و OV2008 أظهرت انخفاض كبير في الجين. تم فحص حالة S0CS2 inethylationفي الأنسجة وخطوط الخلايا باستخدام MSP وتم الكشف عن أن SOCS2 هو methyl في خط خلية OVSAHO ولكن لم يتم الكشف عن أي ميثيل في MICAS و أظهرت الأنسجة السرطانية أن 50CS2ميثيل جزئيا في الختام ، أظهرت هذه الدراسة أن جين SOCS2 يتم نقصانة في مرحلة مبكرة من EOC ، يمكن أن يكون انخفاض التعبير الجيني يسبب آلية أخرى عدا ال hypermnethylation للجين.
9 بعد توحيد العمر، لكل 100 . 000 وعلى الرغم من الجهود البحثية الهائلة التي تحققت في هذا المجال ، لا تزال الآليات الوراثية المرتبطة بهذا المرض غير مفهومة تماما. في الآونة الأخيرة ، ظهرت العديد من التقنيات البيولوجية بما في ذلك الmicroarray ، و (ChIP analysis) وغيرها لتكشف عن مجموعة من الجينات مع إمكانية أن تكون هذه الجينات كعلامات بيولوجية (biomarker) في الخلايا السرطانية مقارنة مع الخلايا الطبيعية. ومع ذلك، لا يوجد دليل ملموس على أن تلك العلامات الحيوية (biomarker) لها دور في الكشف المبكر عن المرض. لذلك، هناك حاجة ماسة للواصمات الحيوية (biomarker) للكشف المبكر عن المرضى المعرضين لخطر سرطان المبيض. في عمل سابق باستخدام تقنية ترسيب الكروماتين ( chromatin( ChIP الدراسة عامل النسخ E2F5 في خط خلية سرطان المبيض MICAS) و .(OVSAH0 تم الحصول على مكتبة صغيرة بواسطة الكروماتين المخصب وتم تنفيذ ChIP - Seq لتعريق تسلسل العناصر التنظيمية النهائية التي تحدها (E2F5 TF) و من بين الجينات المدرجة في القائمة القصيرة -S0CS وجد أنها تخضع لتنظيم جين F2F5 كابح اشارة السيتوكين 2 (SOCS2) هو من عائلة SOCS له دور في مسار التسيخ / JAK (STAT) و أي اضطراب في هذا المسار قد يؤدي إلى العديد من الأمراض مثل اضطرابات المناعة وبعض أنواع السرطان. وقد وجد أن بعض هذه الجينات (SOCS) بمثابة العلامة الحيوية (bionarker) لبعض أنواع السرطان. وقد تبين مؤخرا أن SOCS2 بمثابة العلامة الحيوية (biomarker) في وقت مبكر لسرطان البروستاتا وسرطان القولون والمستقيم الهدف من هذه الدراسة هو استكشاف فور جین S0CS2 في سرطان المبيض الظهاري من خلال مراقبة تعبير الجين في مراحل متنوعة الأنسجة EOC وخطوط الخلايا. درسنا التعبير عن SOCS2 في الأنسجة وخطوط الخلايا باستخدام ( qRT - PCR ) لرصد التعبير التفاضلي SOCS2 في الأنسجة السرطانية والعادية تم العثور على تنظيم منخفض بشكل ملحوظ من 50CS2 في أنسجة Borderline لكنه لم يكن كبيرا في مراحل السرطان الأخرى مثل الأنسجة الحميدة والخبيئة. على الرغم من أن جميع خطوط الخلايا التي تم فحصها MICAS و OVSAH0 و OV2008 أظهرت انخفاض كبير في الجين. تم فحص حالة S0CS2 inethylationفي الأنسجة وخطوط الخلايا باستخدام MSP وتم الكشف عن أن SOCS2 هو methyl في خط خلية OVSAHO ولكن لم يتم الكشف عن أي ميثيل في MICAS و أظهرت الأنسجة السرطانية أن 50CS2ميثيل جزئيا في الختام ، أظهرت هذه الدراسة أن جين SOCS2 يتم نقصانة في مرحلة مبكرة من EOC ، يمكن أن يكون انخفاض التعبير الجيني يسبب آلية أخرى عدا ال hypermnethylation للجين.
Category
Theses and Dissertations