Document

Identification and characterization of mutations in genes implicated in familial hyperchlosterolaemia in Omani families

Publisher
Sultan Qaboos University
Gregorian
2013
Language
English
English abstract
Familial hypercholesterolemia (FH) is a genetic disorder characterized by high level of low density lipoprotein-cholesterol (LDL-C) in the blood leading to early coronary heart disease. An autosomal dominant variant of FH is caused by defects in LDL receptor (LDLR), proprotein convertase subtilisin kexin 9 (PCSK9) or apolipoprotein B (APOB) genes. However, an autosomal recessive variant caused by mutation in LDLR adaptor protein (LDLRAPI) gene. The aims of this thesis are to identify index FH patients, detect mutation in FH associated genes and detect the effect of mutation on different structural levels of protein. As well as study their mode of inheritance. In this study, a molecular analysis of LDLR, PCSK9 and APOB was performed in two Omani families. The two index patients were clinically diagnosed according to Simon Broome criteria. The 21 exons of LDLR gene, 12 exons of PCSK9 gene and exon 26 of APOB gene were analyzed by standard sequencing technique. Then, the pedigree of the two families were established. Moreover, the effect of detected mutations on different structural levels of protein was investigated using standard in silico modules. In family 1, a frame sift mutation was detected in exon 3 of LDLR gene (c.272del) but no mutations were detected in PCSK9 and APOB genes. In family 2, a compound mutation was found in exon 4 of LDLR gene (c.G397A) and exon 9 of PCSK9 gene (c.A1420G). In summary, I studied the mode of inheritance of two LDLR and one PCSK9 mutations in two Omani Arab families. Further, the effect of these mutations on the tertiary structure of the corresponding protein has been investigated with standard bioinformatics.
Arabic abstract
إرتفاع الكوليسترول الوراثي يحدث نتيجة خلل جيني يؤدي الى إرتفاع الدهون منخفضة الكثافة في الدم الأمر الذي يساعد على حدوث تصلب الشرايين أو أزمة قلبية مبكرة يحدث ارتفاع الكوليستيرول نتيجة حدوث طفرة جينية في أحد هذه الجينات وهي: , LDLR , PCSK9 , APOB و LDLRP1.
الهدف من الدراسة هو الحصول على مريض لديه مؤشرات ارتفاع الكوليستيرول الوراثي ثم التعرف على طريقة إنتقال الطفرة الوراثية في عائلة المريض. كذلك التعرف على تأثير الطفرة الجينية على شكل البروتين.
في هذه الدراسة تم عمل تحليل جزيئي للجينات: LDLR , PCSK9 , APOB في عائلتين عمانيتين. ثم التعرف على المريض صاحب مؤشرات ارتفاع الكوليستيرول الوراثي باستخدام طريقة Simon Broome criteria. ثم تحليل الجزيئي لكل من: exons of PCSK9 gene , 21 exons of LDLR gene 12 و exon 26 of APOB gene عن طريق استخدام standard sequencing technique. ثم محاكاة تأثير الطفرات المعرفة عند العائلتين على البروتينات عن طريق استخدام برنامج حاسوبي في احدى العائلتين تم التعرف على طفرة جينية في الجين LDLR وهو ( c. 272delG) ولكن لم يتم التعرف على أي طفرة في الجينين PCSK9و APOB. اما العائلة الثانية فتم التعرف على الطفرة في الجين LDLR وهو ( c . G397A) وفي الجين PCSK9 وهو ( c. A1420G).
والخلاصة: لقد تم دراسة طريقة انتقال طفرة جينية في الجينين LDLRو PCSK9 في عائلتين عمانيتين. بالاضافة الى دراسة تأثير هذه الطفرات المعرفة في هذه الدراسة على شكل البروتين.
Category
Theses and Dissertations

Same Subject

Journal articles
0
0
Keshav, B. R.
College of Medicine, Sultan Qaboos University.
2010-04
Journal articles
0
0
Meles, K.
Sultan Qaboos university
2000
Theses and Dissertations
0
0
Al-Barwaniyah, Hamida Sarhan.
Sultan Qaboos University
2006
Journal articles
0
0
Norollahi, Seyedeh Elham.
Oman Medical Speciality Board.
2021-11