Document
Kinetic studies of the inhibition of GABA-T by y-vinyl GABA and taurine
Publisher
Sultan Qaboos University
Gregorian
2001
Language
English
Subject
English abstract
y-Aminobutyric acid transaminase (GABA-T, EC 2.6.1.19) is a pyridoxal-5 phosphate (PLP) dependent enzyme that catalyzes the degradation of y-aminobutyric acid. The kinetics of this reaction are studied in vitro, both in the absence, and in the presence of two inhibitors: y-vinyl GABA (4-aminohex-5-enoic acid), and taurine. The former is a prescription pharmaceutical used by patients suffering from epile and schizophrenia, whereas, the latter is a natural product.
A kinetic model that is based on a theoretically derived rate equation is proposed. This model describes the kinetics of the transamination process, accounting for the competitive inhibition of y-vinyl GABA and taurine with respect to GABA, and for the uncompetitive inhibition of taurine with respect to a ketoglutarate.
The steady-state kinetic mechanism of GABA-T from Pseudomonas fluorecens obeys a ping-pong bi bi reaction mechanism. In absence of inhibition, at pH 8.6 and a temperature of 25 °C, Vimax was found to be 1.11 x 10° Ms', whereas, Km was found to be 1.28 + 0.1mM, and 1.63 $ 0.1mM for GABA and a ketoglutarate respectively.
The consequences of the GABA-T inhibition on the primary and secondary plots of the initial velocity against the substrates concentrations are examined. The difference in the inhibition mechanism and power of taurine with respect to y-vinyl GABA is also assessed. Y-Vinyl GABA and taurine are competitive inhibitors with respect to GABA. The respective Ki values were found to equal 26.2 + 3mM and 56.9 † 7mM. Taurine, on the other hand, was found to be an uncompetitive inhibitor of GABA-T with respect to a-ketoglutarate, with a Kii value of 213 + 10mM", whereas y-vinyl GABA showed no effect on the transamination ofa ketoglutarate with GABA-T
Member of
Resource URL
Arabic abstract
الخلاصة يعتمد إنزيم حمض جاما أمينوبيوتايريك ترازمينيز (جابات على مجموعة بيرودوکسال الفوسفات ويعمل على تحفيز تكسير حمض جاما أمينوبيوتايريك (جابا). في هذه الدراسة تمت دراسة حركية تفاعل (جابا . ت) في وجود وغياب مثبطين للتفاعل، هما جاما ۔ فينيل جابا وتورين. جاما فينيل جابا مستحضر دواني يستخدم بواسطة مرضى الصرع، إنفصام الشخصية، وغيرها، اما تورين فهو مركب طبيعي. يعمل جابا بواسطة الية بنق - بونق مزدوجة النواتج والتفاعلات. يتميز هذا التفاعل بسرعة قصوى تبلغ ۲۰۱۰x۱ ، ۱۱ (مولار/ثانية) وثابت ميكاليز (كم) ۱, ۲۸ و ۱٫۹۳ ملمولار لجابا وألفا- كيتو جلوترات على التوالي.. تمت في هذه الدراسة أيضا دراسة أثر المثبطين جاما فينيل جابا وتورين على التفاعل وتبين أن جاما فينيل جابا يثبط تكسير جابا فقط وبطريقة تنافسية وبثابت تفاعل مقداره ۲۶٫۲ (۱/ملمولار). أما في حالة تورين فإن آلية التثبيط وجدت تنافسية مع جابا، ثابت التفاعل يساوي 56, ۹ (1ملمولار) وبآلية غير تنافسية مع ألفا کیتوجلوترات وبثابت تفاعل قدره ۲۱۳ (1ملمولار).
Category
Theses and Dissertations