Document
The putative regulation of K-Ras/B-Raf pathway by Sos 1/2 proteins in colon cancer cell lines
Publisher
Sultan Qaboos University
Gregorian
2011
Language
English
English abstract
Colorectal cancer (CRC) is a disease caused by a serial of genetic mutations and epigenetic aberrations including the signal transduction pathways. The MAPK pathway regulated by the Ras proteins upon activation by growth factors is the most commonly mutated. This causes a cascade of downstream protein phosphorylation and activation causing gene expression. In CRC, the MAPK pathway carries gain-of-function mutations in both KRAS and BRAF genes, generally activated by the upstream Sos1/2 proteins, which have not been well explored in CRCs especially in the K-Ras and B-Raf mutations carriers. The aim of this study was to observe the effect of Sosi and So$2 proteins on the regulation of the MAPK pathway when KRAS and BRAF mutations are present by monitoring the expression of the downstream proteins, MEK and ERK and their related phosphorylation forms. We knocked down Sosl and Sos2 proteins in HT-29, Caco-2 and MDA-MB-231 cells using Sosl siRNA. Specific exons of KRAS, BRAF, SOSI and SOS2 genes were amplified and subjected to sequencing to confirm the previously reported mutations. Western bolt was performed using anti-Sosl, anti-Sos2, anti-MEK, anti-pMĘK, anti-ERK and anti-PERK antibodies. All mutations (KRAS (G13D), BRAF (G464V) in MDA-MB-231 cells; BRAF (V600E) in HT-29 cells) reported in the literature about cell lines used in this study were confirmed by sequencing in this study. Knockdown of Sosl protein was observed when HT-29, Caco-2 and MDA-MB-231 cells were treated with siRNA directed against Sosl. In Caco-2 cells, Sos1 expressions as well as p-MEK and p-ERK were reduced after 18 hours of transfection. Whereas, a gradual knockdown of Sos1 protein was observed in MDA-MD 231 cells at 18 and 24 hours after transfection without affecting the expression of the downstream effectors. In HT-29 cells, siRNA Sosi transfection did not cause any change in the expression of the Sosi protein, indicating the inefficient shutdown of the protein. In conclusion this study demonstrated that Sos1/2 proteins are not necessary for the regulation of MAPK pathway when gain-of function mutations of KRAS and BRAF are present in a tumour cell and the regulation of the pathway could be coupled with proteins of other pathways to support tumourogenesis.
Description
Thesis
Member of
Resource URL
Arabic abstract
التنظيم الإفتراضي لمسار K - Ras B - Raf عن طريق بروتينات ال 1 / 2
Sos في خلايا القولون السرطانية سرطان القولون (CRC) هو مرض ناتج عن تسلسل في الطفرات الجينية والانحرافات الجينية بما في ذلك مسارات نقل الإشارة (signal transduction pathway). المشار MAPK هو أحد هذه المسارات والذي ينظمه . بروتينات ال RAS الأكثر شيوعا في التحوين) حيث تنشط بعوامل النمو والذي يسبب سلسلة من فسفرة البروتينات التي تقع في هذا المسار. وهذا بدوره يسبب تنشيط الجينات لإنتاج البروتينات المطلوبة. في بعض حالات سرطان القولون, مسار MAPK يحمل طفرات تساهم في زيادة معدل نشاط كل من البروتينات KRAS و BRAFوالتي يتم تنشيطها عن طريق البروتينات Sos1/2 الواقعة أعلى المسار. هذه البروتينات لم يتم استكشافها بشكل جيد في سرطان القولون الذي يحوي طفرات في جينات ال BRAF تهدف هذه الدراسة الى مراقبة تأثير بروتينات KRAS . Sos1و Sos2 بشان تنظيم مسار MAPK عند وجود طفرات في جينات ال BRAF KRAS من خلال رصد نشاط البروتينات وأنواعها المفسفرة الواقعة أسفل المسار قمنا بتعطيل انتاج البروتينات Sosl و Sos2 في خلايا 29 : HT و2-Caco و 231- MDA - MB وذلك عن طريق استخدام الحمض النووي الرايبوزي المعيق (siRNA) المضاد لSosi . باستخدام سلسلة التفاعلات المبلمرة (PCR تم . تكثير المناطق الجينية المعينة المسؤولة عن انتاج البروتين (exons) الواقعة في جينات KRAS و BRAF و SOS1 و SOS2، واخضعوا للتسلسل والتحليل للتأكد من الطفرات المذكورة سابقا في دراسات أخرى. تم تنفيذ تقنية طبع البروتينات ( Western blot) واستخدام الأجسام المضادة لي Sos1 و Sos2 و MEK و pMEK و ERK و pERK.
Sos في خلايا القولون السرطانية سرطان القولون (CRC) هو مرض ناتج عن تسلسل في الطفرات الجينية والانحرافات الجينية بما في ذلك مسارات نقل الإشارة (signal transduction pathway). المشار MAPK هو أحد هذه المسارات والذي ينظمه . بروتينات ال RAS الأكثر شيوعا في التحوين) حيث تنشط بعوامل النمو والذي يسبب سلسلة من فسفرة البروتينات التي تقع في هذا المسار. وهذا بدوره يسبب تنشيط الجينات لإنتاج البروتينات المطلوبة. في بعض حالات سرطان القولون, مسار MAPK يحمل طفرات تساهم في زيادة معدل نشاط كل من البروتينات KRAS و BRAFوالتي يتم تنشيطها عن طريق البروتينات Sos1/2 الواقعة أعلى المسار. هذه البروتينات لم يتم استكشافها بشكل جيد في سرطان القولون الذي يحوي طفرات في جينات ال BRAF تهدف هذه الدراسة الى مراقبة تأثير بروتينات KRAS . Sos1و Sos2 بشان تنظيم مسار MAPK عند وجود طفرات في جينات ال BRAF KRAS من خلال رصد نشاط البروتينات وأنواعها المفسفرة الواقعة أسفل المسار قمنا بتعطيل انتاج البروتينات Sosl و Sos2 في خلايا 29 : HT و2-Caco و 231- MDA - MB وذلك عن طريق استخدام الحمض النووي الرايبوزي المعيق (siRNA) المضاد لSosi . باستخدام سلسلة التفاعلات المبلمرة (PCR تم . تكثير المناطق الجينية المعينة المسؤولة عن انتاج البروتين (exons) الواقعة في جينات KRAS و BRAF و SOS1 و SOS2، واخضعوا للتسلسل والتحليل للتأكد من الطفرات المذكورة سابقا في دراسات أخرى. تم تنفيذ تقنية طبع البروتينات ( Western blot) واستخدام الأجسام المضادة لي Sos1 و Sos2 و MEK و pMEK و ERK و pERK.
Category
Theses and Dissertations